Progesteron dapat ditentukan jika seorang wanita memiliki siklus menstruasi yang normal dan kemudian berhenti mengalami menstruasi. Selama kehamilan, terutama selama trimester pertama, suplemen progesteron dapat membantu menjaga kehamilan. Progesteron juga diresepkan pasca-menopause wanita selama terapi penggantian hormon.
Progesteron dapat menyebabkan beberapa efek samping. Sakit kepala, nyeri payudara, diare, keputihan, dan masalah dengan buang air kecil adalah efek samping beberapa yang cenderung bersifat sementara. Jika bertahan, seorang wanita mengkonsumsi suplemen Progesteron harus memberitahu dokter. Beberapa orang mengambil Progesteron mungkin mengalami pusing atau mengantuk. Progesteron itu tidak boleh diambil sebelum mengemudi atau mengoperasikan mesin berat. Efek Samping lain mungkin lebih serius, dan jika mereka terjadi, seorang wanita mengambil Progesteron harus menghubungi dokter segera. Karena Progesteron menyebabkan peningkatan pembekuan darah, dapat berkontribusi terhadap serangan jantung, pembekuan darah di paru-paru dan kaki, atau bahkan stroke. Beberapa tanda seperti Efek Samping serius adalah nyeri dada, penglihatan kabur atau kehilangan penglihatan, mati rasa atau kesemutan di lengan atau kaki, dan tiba-tiba sesak napas. Efek Samping serius lainnya yang memerlukan perhatian medis segera adalah pendarahan vagina yang tidak terduga, benjolan payudara, migren, dan gemetar tak terkendali.
Beberapa merek kapsul Progesteron, seperti Prometrium, mengandung minyak kacang dan dapat memicu reaksi alergi yang mengancam nyawa pada orang yang alergi terhadap kacang. Wanita di atas usia 65 yang mengambil Progesteron sebagai bagian dari terapi hormon pengganti akan meningkatkan risiko terkena demensia. Wanita yang menderita depresi juga bisa mengalami memburuknya depresi mereka saat mengambil suplemen progesteron. Senyawa progesteron sintetik atau progestogen penurunan ‘baik’ kolesterol HDL, dapat meningkatkan tekanan darah, memberikan kontribusi untuk gangguan mood, dan mungkin memberi efek hormon laki-laki seperti pertumbuhan rambut wajah meningkat. Perempuan mengambil Progesteron sintetik harus beralih ke Progesteron alami, yang tidak mengerahkan Efek Samping ini.